High performance computation of landscape genomic models integrating local indices of spatial association
Stucki, Sylvie; Orozco-terWengel, Pablo; Bruford, Michael W.; Colli, Licia; Masembe, Charles; Negrini, Riccardo; Taberlet, Pierre; Joost, Stéphane
2014

Fichiers

Résumé

Motivation: The increasing availability of high-throughput datasets requires powerful methods to support the detection of signatures of selection in landscape genomics. Results: We present an integrated approach to study signatures of local adaptation, providing rapid processing of whole genome data and enabling assessment of spatial association using molecular markers. Availabilty: Sam{\ss}ada is an open source software written in C++ available at http:lasig.epfl.ch/sambada (under the license GNU GPL 3). Compiled versions are provided for Windows, Linux and MacOS X.

Détails

Titre High performance computation of landscape genomic models integrating local indices of spatial association
Auteur(s) Stucki, Sylvie ; Orozco-terWengel, Pablo ; Bruford, Michael W. ; Colli, Licia ; Masembe, Charles ; Negrini, Riccardo ; Taberlet, Pierre ; Joost, Stéphane
Publié dans arXiv
Volume [q-bio.PE]
Numéro arXiv:1405.7658v1
Date 2014
Autres identifiant(s) View record in ArXiv
Laboratoires LASIG
Le document apparaît dans Production scientifique et compétences > ENAC - Faculté de l'environnement naturel, architectural et construit > IIE - Institut d'ingénierie de l'environnement > LASIG - Laboratoire de systèmes d'information géographique
Publications validées par des pairs
Travail produit à l'EPFL
Articles de journaux
Publié
Date de création de la notice 2014-05-30

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