3D Reconstruction and Comparison of Shapes of DNA Minicircles Observed by Cryo-Electron Microscopy
Amzallag, A.; Vaillant, C.; Jacob, M.; Unser, M.; Bednar, J.; Kahn, J.D.; Dubochet, J.; Stasiak, A.; Maddocks, J.H.
2006

Fichiers

Résumé

We use cryo-electron microscopy to compare 3D shapes of 158 bp long DNA minicircles that differ only in the sequence within an 18 bp block containing either a TATA box or a catabolite activator protein binding site. We present a sorting algorithm that correlates the reconstructed shapes and groups them into distinct categories. We conclude that the presence of the TATA box sequence, which is believed to be easily bent, does not significantly affect the observed shapes.

Détails

Titre 3D Reconstruction and Comparison of Shapes of DNA Minicircles Observed by Cryo-Electron Microscopy
Auteur(s) Amzallag, A. ; Vaillant, C. ; Jacob, M. ; Unser, M. ; Bednar, J. ; Kahn, J.D. ; Dubochet, J. ; Stasiak, A. ; Maddocks, J.H.
Publié dans Nucleic Acids Research
Volume 34
Numéro 18
Pages e125
Date 2006
Editeur The Author(s)
Mots-clés (libres)
DOI https://doi.org/10.1093/nar/gkl675
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Date de création de la notice 2008-12-10

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